INFLUÊNCIA DO NÚMERO DE OBSERVAÇÕES NO AGRUPAMENTO DE PERFIS DE EXPRESSÃO GÊNICA TEMPORAL
Palavras-chave:
Fibroblastos, Expressão Gênica, séries temporaisResumo
A análise de dados de expressão gênica identificada ao longo do tempo – "microarray time series" (MTS) – tem possibilitado o entendimento de diversos processos biológicos uma vez que o conhecimento de grupos de genes que se expressam de forma similar possibilita inferir a respeito de funções e mecanismos reguladores desses genes. Dentre as diversas metodologias, devido ao seu apelo biológico o método proposto por RAMONI et al., (2002) apresenta destaque. Entretanto, uma característica intrínseca a estudos de MTS é o pequeno número de observações temporais. Assim, a utilização de métodos robustos ao pequeno número de observações temporais torna-se de extremo interesse. Assim, este trabalho teve por objetivo avaliar a robustez do método baseando na dinâmica do padrão da expressão quanto ao número de observações temporais. Foram utilizados dados que se referem à resposta de fibroblastos humanos ao soro. Estes correspondem a 517 genes cujo nível de expressão foi alterado em resposta á estimulação do soro. Esses experimentos foram repetidos sequencialmente ao longo de 12 diferentes instantes de tempo (0, 15, 30, 60, 120, 240, 360, 480,720, 960, 1200 e 1440 min.). O método avaliado é robusto, visto que o mesmo apresentou o mesmo número de grupos e altos valores de percentual de concordância até três perdas de observações temporais.
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